Небольшой теплый («зимний») храм Николы на Пенье, или Николы Пенского, был построен в 1691 году. Это храм отличается нетрадиционной для ярославских храмов колокольней с круглыми колоннами, поддерживающими шатер с фигурными окнами. Сама церковь даже немного теряется на фоне колокольни. С севера к храму сделана позднейшая пристройка конца XIX века, слабо гармонирующая с простым и скромным основным объемом.